0% Complete
فارسی
Home
/
سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران
In-silico Molecular Investigation of Caloubater crescentus Bioadhesive Proteins
Authors :
Yeganeh Kayalha
1
Maryam Azimzadeh Irani
2
1- دانشگاه شهید بهشتی
2- Faculty of Life Sciences and Biotechnology Shahid Beheshti University
Keywords :
Holdfast،Bacterial bioadhesive،Protein structure،Immunoinformatics
Abstract :
Caulobacter crescentus, also known as Caulobacter vibrioides, produces a specialized adhesive structure, the holdfast—a polysaccharide-rich matrix located at the stalk tip that enables strong surface attachment. This structure allows strong attachment through its potent adhesive properties. The “holdfast” in this bacterium is believed to have the highest tensile strength of any known biological adhesive. Three major membrane-associated proteins—HfaA, HfaB, and HfaD—are anchoring components of the holdfast, which enhances its interaction with polysaccharides and thereby reinforces stable surface attachment. In this study, Bioinformatics analyses were performed. BLAST and multiple sequence alignment revealed conserved regions across the proteins. At the same time, phylogenetic analysis indicated a close relationship between Cp19k barnacle’s adhesive protein and HfaA, with HfaB forming a more distant group with Cp20k barnacle’s adhesive protein variants, which, along with Cp19k, are bioadhesive proteins commonly found in barnacles. Structural modeling using AlphaFold2 showed that HfaA had moderate confidence with flexible regions, in the central and C-terminal domains (pLDDT ~64). HfaB displayed greater stability (pLDDT >75), while HfaD achieved the highest confidence scores (pLDDT >91), with consistent folding across all models. The Epitope prediction using DiscoTope identified multiple B-cell epitope regions in HfaA and HfaB, but limited immunogenicity in HfaD. AlphaFold-Multimer modeling of the protein complex yielded low inter-chain confidence (ipTM <0.20), suggesting weak subunit interaction. These results may lead to the development of biocompatible bioadhesive materials for medical and industrial usage.
Papers List
List of archived papers
حسابداری توسعه پایدار با رویکرد اقتصاد هوشمند
مهدی زینالی - علیرضا صابر - رامین فتح الله زاده دیزجی - احمد حسن پور
ارتباط بین رفتار سرمایه گذاری و خطر سقوط قیمت سهام
بیتا دلنواز اصغری - لیلا محمدی - بهنام رنجبرالوار - مهدی پورعلی
Biomechanical Evaluation and Comparison of Spinal Fixators in the Lumbar (L3–L4) Region Using the Finite Element Method
Nima Moazed - Mohammad Haghpanahi
بررسی عوامل موثر بر بهبود مالیات ستانی از اقتصاد دیجیتال در کشور (مورد مطالعه سازمان امور مالیاتی استان تهران)
نسار احمدی - ملک تاج ملکی اسکوئی
طراحی مدل توزیع ناب - کلاس جهانی در صنعت برق ایران
رکسانا رادمنشی
Improving Effectivity of repetitive Transcranial Magnetic Stimulation in Treatment of Amyotrophic Lateral Sclerosis by Designing New Protocol and Using Machine Learning
Ali Abedi - Gholamreza Moradi - Reza Sarraf Shirazi - Mehran Jahed
بهبود امنیت شبکههای رایانش ابری مبتنی بر معماری OpenFlow با استفاده از SVM
سویل قنبرزاده چاوشی
کاربرد هوش مصنوعی برای پیشبینی تقاضا در مدیریت زنجیره تامین
امیرمحمد ایل غمی
تشخیص بیماری MS با استفاده از EfficientNet-B0 و CycleGAN بر پایه نقشههای ضخامت شبکیه
محبوبه سبزه یان - مریم سبزه یان - ماندانا سادات غفوریان - امین نوری
بررسی تاثیر ارزش ویژه برند بر هوشمندسازی رفتار تبلیغاتی مصرفکنندگان موبایل با نقش میانجی گری عشق به برند(مطالعه موردی: برند سامسونگ)
زهرا علی میرزائی - حسین بوداقی
more
Samin Hamayesh - Version 44.4.0