0% Complete
English
صفحه اصلی
/
سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران
Enhancing Drug–Target Affinity Prediction with Non-Local Block Graph Neural Networks
نویسندگان :
Reza Tahmasebi
1
Eghbal Mansoori
2
Armin Piashehvar
3
Abbas Mehrbaniyan
4
1- دانشگاه شیراز
2- دانشگاه شیراز
3- دانشگاه شیراز
4- دانشگاه شیراز
کلمات کلیدی :
Drug target affinity،Graph neural network،Non-local attention،Protein ligand interaction،Virtual screening،Deep learning،Contact maps،Kinase
چکیده :
Predicting how strongly a drug binds to its protein target is key to speeding up drug discovery. Many graph neural networks excel with local chemical features but often overlook important long-range contacts, particularly when they become deep and challenging to train. In this paper, we present a compact graph neural network model, called NLB-DTA, that adds a single non-local attention block between two light convolutional layers in distinct ligand and protein streams. This block considers the contribution of each atom to other atoms in the molecular downstream and residues in the protein downstream in a single step, capturing distant interactions between atoms and residues. Tested on the widely used Davis dataset, the model achieves state-of-the-art accuracy with high generalization. Since NLB-DTA needs only standard ligand strings and protein sequences, it can run on common GPUs. Our study shows that using a non-local layer is effective in considering the long-range information gap, and so it offers a practical foundation for future virtual screening.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
یادگیری عمیق مبتنی بر مکانیسم توجه جمعیت برای تحلیل احساسات بلادرنگ در چتهای زنده یوتیوب
علی فرزین
مقایسه روشهای مختلف دوخت تاندون فلکسور دست با استفاده از آنالیز اجزای محدود
امیررضا کاظمی - محمد جعفری - محمد مهدی جلیلی - سید حسین سعید بنادکی
Static and Dynamic WPLI on Stressful Scenarios: an EEG Study
Nasrin Dehghani - Negin Joghataei - Zahra Ghanbari - Mohammad Hassan Moradi
بررسی ادبیات سیستماتیک در مورد عوامل تعیین کننده قیمت گذاری ارزهای
بیتا دلنواز - بهارک یادگار جمشیدی - سلوی حسینی
Multi-View 2.5D Attention U-Net with 3D Fusion for Efficient Stroke Lesion Segmentation from T1-Weighted MRI
Fatemeh Salahshourinejad - Kamran Kazemi - Negar Noorizadeh - Mohammad Sadegh Helfroush - Ardalan Aarabi
EEG-based Schizophrenia Detection Using Spectral, Entropy, and Graph Connectivity Features with Machine Learning
Nazila Ahmadi Daryakenari - Seyed Kamaledin Setarehdan
تحول دیجیتال سازمانی: از تکامل تا روندهای آینده
بیتا دلنواز دلنواز - عرفان درخشی - پویا خارراضی
Late Fusion-Based Deep Learning for Breast Cancer Classification in Mammography
Mehdi Baharloo - Ata Jodeiri
بررسی رابطه سیاست های تامین مالی شرکت و عملکرد شرکت بر افشای ریسک در شرکتهای پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
بهاره فضلی
تأثیر گردش سیاسی بر رفتار گزارشگری حسابرس با تأکید بر اندازه موسسه حسابرسی
فریور بلندنظر - مرتضی خانلاری
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.5.2