سامانه همایش‌ها TSTA | ثبت‌نام و ارسال مقاله کنفرانس‌ها و کنگره‌های ملی

صفحه اصلی / سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران

معرفی معیار کمی‌سازی الگوهای متیلاسیون DNA در ژنوم

نویسندگان :

نغمه سادات ناظر کاخکی¹ نرجس الهدی محمدزاده² محیا مهرمحمدی³

1- دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران 2- دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

متیلاسیون DNA،توالی یابی نسل جدید،بیوپسی مایع،طبقه بندی،کشف بیومارکر

چکیده :

متیلاسیون DNA به عنوان یکی از مهم‌ترین مکانیسم‌های اپی‌ژنتیکی، نقش کلیدی در تنظیم بیان ژن‌ها ایفا می‌کند. تغییرات الگوهای متیلاسیون در نواحی CpG ژنومی با طیف وسیعی از بیماری‌ها از جمله سرطان و بیماری‌های عصبی مرتبط است. این ویژگی، متیلاسیون DNA را به ابزاری ارزشمند در تشخیص بیماری‌ها و مطالعات اپی‌ژنومیک تبدیل کرده است. در این مطالعه، معیار جدیدی به نام شاخص یکپارچگی الگوی متیلاسیون، MPCI معرفی شده است که با تحلیل همزمان CpGهای متیله و غیرمتیله در سطح تک‌خوانش‌های حاصل از توالی‌یابی، امکان ارزیابی جامعی از الگوهای متیلاسیون را فراهم می‌آورد. این روش با در نظر گرفتن همبستگی بین CpGهای مجاور و محاسبه یکپارچگی الگوها در خوانش‌های مختلف، محدودیت‌های روش‌های مرسوم مانند بار هپلوتایپ متیلاسیون به نام MHL را مرتفع می‌سازد. نتایج نشان می‌دهد MPCI در تمایز انواع سلول‌های نزدیک به هم (مانند لنفوسیت‌های CD4 و CD8) با بهبود ۱۳۸.۹٪ در صحت تشخیص، عملکردی برتر از MHL دارد. همچنین در سناریوهای بیوپسی مایع در غلظت‌های کم ، این روش میانگین صحت را 11.5٪ افزایش می‌دهد که نشان‌دهنده دقت بالاتر آن در تشخیص زودهنگام بیماری‌هاست. این مطالعه بر اهمیت تحلیل الگوهای متیلاسیون به جای تمرکز بر تک سایت‌های CpG تأکید دارد و نشان می‌دهد که MPCI با کمی‌سازی الگوی متیلاسیون در خوانش‌ها، ابزاری ارزشمند برای کشف نشانگرهای زیستی، طبقه‌بندی بافت‌های مختلف و تشخیص بیماری در بیوپسی مایع محسوب می‌شود.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

بررسی تاثیر ورشکستگی بر رابطه بین استراتژی‎های تجاری و معیارهای عملکرد شرکت (ESG)

جواد پورغفار - ایوب یغمائی علیشاه

تأثیر فعالیت های بازاریابی تجربی بر تجربه مشتری در متاورس: نقش واسطه ای سهولت درک شده و سودمندی درک شده و تأثیر آن بر عشق به برند

آیسان خضرلو - سید جعفر زنوزی

مدل‌سازی پیش‌بینی سکته مغزی با الگوریتم‌های تقویتی و شبکه‌های عصبی در داده‌های نامتعادل

ملیحه نیک سیرت - سیده فاطمه جوادی

بررسی تأثیر سبک نگارش بر نحوه بازیابی پاسخ توسط مدل‌های‌زبانی‌بزرگ با استفاده از ژئومتریک

مینا زالی - مریم شفائی - فاطمه فاقعی شهربابکی

بازیابی لحظات ویدئویی در بازی‌های رایانه‌ای: از مدل‌های زبانی بزرگ تا یادگیری تقابلی

محمد گل زوری - پارسا ذاکرحیات - مصطفی عمری

آینده پژوهی فرصتها و چالشهای احتمالی در صنعت بیمه ایران

حسین خانلو

Edge AI for Real-Time UAV Data Processing

Mohammad Mahdi Salmani

Fibroglandular Tissue Classification in Breast MRI: A Comparative Study of Automated Decision Strategies

Meysam Khalaj - Arvin Arian - Ala Torabi - Nasrin Ahmadinejad - Masoumeh Gity - Seyedeh Nooshin Miratashi Yazdi - Mohammad Pooya Afshari - Melika Sadeghi Tabrizi - Hamid Soltanian-Zadeh

تاثیر قابلیت مقایسه صورت‌های مالی بر مربوط بودن اطلاعات حسابداری

محمد فرجی بنائی - نیما تمجیدی فر - امیرحسین قوچی

بررسی نقش حسابداری مدیریت در بهبود تصمیم‌گیری استراتژیک

علی اصغر نورمحمدی

بیشتر