سامانه همایش‌ها TSTA | ثبت‌نام و ارسال مقاله کنفرانس‌ها و کنگره‌های ملی

صفحه اصلی / سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران

معرفی معیار کمی‌سازی الگوهای متیلاسیون DNA در ژنوم

نویسندگان :

نغمه سادات ناظر کاخکی¹ نرجس الهدی محمدزاده² محیا مهرمحمدی³

1- دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران 2- دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

متیلاسیون DNA،توالی یابی نسل جدید،بیوپسی مایع،طبقه بندی،کشف بیومارکر

چکیده :

متیلاسیون DNA به عنوان یکی از مهم‌ترین مکانیسم‌های اپی‌ژنتیکی، نقش کلیدی در تنظیم بیان ژن‌ها ایفا می‌کند. تغییرات الگوهای متیلاسیون در نواحی CpG ژنومی با طیف وسیعی از بیماری‌ها از جمله سرطان و بیماری‌های عصبی مرتبط است. این ویژگی، متیلاسیون DNA را به ابزاری ارزشمند در تشخیص بیماری‌ها و مطالعات اپی‌ژنومیک تبدیل کرده است. در این مطالعه، معیار جدیدی به نام شاخص یکپارچگی الگوی متیلاسیون، MPCI معرفی شده است که با تحلیل همزمان CpGهای متیله و غیرمتیله در سطح تک‌خوانش‌های حاصل از توالی‌یابی، امکان ارزیابی جامعی از الگوهای متیلاسیون را فراهم می‌آورد. این روش با در نظر گرفتن همبستگی بین CpGهای مجاور و محاسبه یکپارچگی الگوها در خوانش‌های مختلف، محدودیت‌های روش‌های مرسوم مانند بار هپلوتایپ متیلاسیون به نام MHL را مرتفع می‌سازد. نتایج نشان می‌دهد MPCI در تمایز انواع سلول‌های نزدیک به هم (مانند لنفوسیت‌های CD4 و CD8) با بهبود ۱۳۸.۹٪ در صحت تشخیص، عملکردی برتر از MHL دارد. همچنین در سناریوهای بیوپسی مایع در غلظت‌های کم ، این روش میانگین صحت را 11.5٪ افزایش می‌دهد که نشان‌دهنده دقت بالاتر آن در تشخیص زودهنگام بیماری‌هاست. این مطالعه بر اهمیت تحلیل الگوهای متیلاسیون به جای تمرکز بر تک سایت‌های CpG تأکید دارد و نشان می‌دهد که MPCI با کمی‌سازی الگوی متیلاسیون در خوانش‌ها، ابزاری ارزشمند برای کشف نشانگرهای زیستی، طبقه‌بندی بافت‌های مختلف و تشخیص بیماری در بیوپسی مایع محسوب می‌شود.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

Addressing Class Imbalance Using Difficulty-based Oversampling with Variance Control

Zahra Asgharzadeh Bonab - Sina Shamekhi

تهدیدهای حریم خصوصی در شهرهای هوشمند

محمد امیری نسب - محمد عادلی نیا

Proposed Amniotic Membrane/Alginate Dialdehyde Based Injectable Hydrogel as a Biofunctional Scaffold for Soft Tissue Engineering

Yasaman Pahlavanzadeh - Yousef Mohammadi - Maryam Saadatmand

هم‌آوایی در شبکه‌ای جهان‌کوچک و متشکل از نورون‌های ممریستوری

محمد‌مهدی شیرزاد - مهتاب مهراب بیک - سجاد جعفری

Dynamic Cross-Frequency Coupling Reveals Task Dependent Neural Engagement During Varying Cognitive Demands

Seyed Saman Sajadi - Babak Fazli - Fateme Karbasi - Ehsan Garosi - Milad Jalilian - Soheila Hosseinzadeh - Amir Homayoun Jafari - Seyed Abolfazl Zakerian

ارزیابی تأثیر اندازه موجودیها و کیفیت سود بر توان واریز بدهی ها در بین شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران

سمانه یاقوتی آذری - مهسا ریخته گری نظامی - نادر رضایی

تحلیلی جامع بر روندهای نوین بازاریابی محتوایی در فروشگاه‌های آنلاین در سال‌های ۲۰۲۴ و ۲۰۲۵

سید رامان سیدی - آرش احمدی - مریم باباپیری

Dynamic Modeling of a Cable-Driven Series Elastic Upper Extremity Exoskeleton for Post-Stroke Rehabilitation

Ali Selk Ghafari - Omid Kalantari

مروری بر روش‌های پیش‌بینی رفتار کاربران در فضای مجازی

امیرحسین شعیبی - مجید عبدالرزاق نژاد

Alterations in Muscle Coordination During Different Gait Phases Following Knee Injury

Shaghayegh Hassanzadeh Khanmiri - Alireza Hashemi Oskouei - Peyvand Ghaderyan

بیشتر